一、报告题目

整合冷冻电镜实验的蛋白质/核酸复合结构建模

二、主讲人

肖奕（华中科技大学）

三、报告时间

2024年5月19日 08:00–12:00

四、报告地点

华岗苑东楼E119

腾讯会议：688 588 8863

五、摘要

蛋白质和核酸(DNA/RNA)在许多生命过程中发挥重要作用，其形成的复合物结构对于理解生命活动的分子机制及开发药物至关重要。由于其清晰的物理原理和极低的计算成本，分子对接已成为蛋白质/核酸复合物结构预测中最重要的一种快速计算方法，然而，由于分子柔性和能量打分函数等方面的限制，其精度已达到瓶颈。尽管近年来人工智能模型如AlphaFold在蛋白质单体结构预测中取得了巨大成功，但由于样本不足，其对复合物特别是RNA结构预测仍未解决。因此，迫切需要整合实验信息来突破现有复合物和RNA结构预测的瓶颈。近年来，冷冻电镜已发展成为实验测定生物大分子结构最重要的方法，其实验数据中蕴含的信息正好契合了蛋白质/核酸复合物结构预测的需求。在本报告中，将首先介绍发展的基于分子对接的蛋白质/核酸复合物结构预测方法HDOCK，然后重点汇报最近关于利用人工智能整合冷冻电镜实验数据进行蛋白质复合物和RNA三维结构建模的研究。

六、主讲人简介

肖奕，华中科技大学物理学院教授。1981年获湖南师范学院物理系理学学士学位，1984年获中国科学院生物物理研究所理学硕士学位，师从徐京华先生和陈润生院士，1988年获上海交通大学应用物理系理学博士学位，师从蔡建华教授和黄念宁教授。现任中国生物信息学学会（筹）核心组成员及生物分子结构预测与模拟专委会主任委员，中国生物物理学会《Biophysics Reports》期刊副主编，主要研究方向为蛋白质和核酸折叠物理机制以及单体与复合物结构预测、生物网络结构和动力学。

七、主办单位

非线性期望前沿科学中心

数学与交叉科学研究中心

中俄数学中心青岛基地