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北京大学郭立研究员做客山海知微

发布日期:2024年07月03日 17:05 点击次数:

[本站讯]6月27日上午,北京大学现代农业研究院研究员郭立受邀做客“山海知微”系列学术论坛,作了题为“辣椒T2T基因组与辣椒素合成通路进化”的学术报告。本次报告由山东大学微生物技术国家重点实验室教授卞小莹主持。

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郭立研究员表示,辣椒素生物合成有两个特异性,物种特异性与时空特异性,即辣椒素只在辣椒属植物中合成,只在果实胎座合成。针对这两个特异性,郭立团队开展了一系列工作。首先对辣椒的基因组进行了测序,成功组装了两个辣椒的端粒到端粒(T2T)的无缺口基因组序列,然后对基因进行标注,并筛选与辣椒素生物合成的相关基因CS基因。分析辣椒素在不同植物中的进化发现,关键合成基因CS只存在于茄科植物中,辣椒属中Ca含有最多的CS功能基因拷贝,郭立研究员进一步解释了都含有辣椒素的植物,有些辣有些不辣是因为不辣的植物其CS基因发生了变异或调控序列缺失,基因上下游的结构变异导致辣椒素只在辣椒中合成,其他茄科植物不能合成。通过多组学数据联合分析,发现了辣椒素关键基因和转录因子的胎座特异性调控序列,解释了辣椒素合成途径的组织特异性机制。

郭立研究员还介绍了其团队对辣椒着丝粒的研究,发现辣椒着丝粒缺乏串联重复序列,Gypsy-LTR转座子插入导致其快速进化,T2T基因组改进了变异检测分析。同时郭立课题组构建了机器学习模拟,基于CNV分析预测辣椒的辣度,能够用于苗期快速评估辣椒素含量,从而缩短育种周期。

讲座最后,郭立研究员与在场师生进行了交流讨论。

郭立,北京大学现代农业研究院研究员、课题组组长(PI)。山东省“杰青”项目、“泰山学者”青年专家项目获得者,美国宾夕法尼亚州立大学博士学位,美国UMASS Amherst 博士后,长期从事园艺作物基因组学、天然产物的生物合成途径与异源合成。主导完成多个重要作物的复杂基因组序列的破译,揭示关键次生代谢通路的演化历史,解析了天然产物生物合成通路,助力开发天然产物高效生物合成细胞工厂和作物品质改良。现已发表SCI论文40余篇,包括以第一作者或通讯作者身份发表在Science、PNAS、Nature Communications、New Phytologist等期刊;现担任MPMI副主编,Plant Physiology and Biochemistry期刊客座编辑;为多个国际权威期刊审稿200余次,被评为2022年度中国科技期刊卓越行动计划优秀审稿人。


【供稿单位:微生物研究院    作者:郝兴坤    摄影:郝兴坤         编辑:新闻网工作室    责任编辑:蒋晓涵 温梓玉  】

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