[本站讯]近日,公共卫生学院薛付忠教授团队青年教师侯庆振,依托国家健康医疗大数据研究院平台在国际期刊Nucleic Acids Research(五年影响因子 16.8)发表最新成果,发布了全球首个单外泌体(Single Extracellular Vesicles)多组学图谱——SVAtlas。山东大学硕士研究生魏中慧、周娜为论文共同第一作者,侯庆振副研究员和薛付忠教授为共同通讯作者,山东大学为论文第一作者单位和唯一通讯作者单位。

细胞外囊泡(EVs)是人体内细胞释放的纳米级颗粒,携带蛋白质、核酸等重要分子,在细胞间通讯和疾病进展中起到关键作用。EVs存在于血液、尿液等易获取的体液中,其稳定的膜结构能保护内部的分子“货物”,EVs已成为针对癌症和神经退行性疾病等进行“液体活检”的理想研究对象。然而,EVs群体内部存在巨大的分子异质性,传统的批量分析方法无法分辨单个EV的分子差异,导致来自稀有病变细胞的关键诊断信息被掩盖,严重制约了其临床转化应用。
为突破这一瓶颈,研究团队整合自主测序数据与全球276个科研项目成果,首次构建了单外泌体分子图谱SVAtlas。该图谱覆盖31种重大疾病,包含32种组织器官和10种生物体液的数据,收录了来自超过1.37亿个单囊泡的8120个蛋白质条目和106个RNA条目(包括mRNA, miRNA, lncRNA和circRNA)。

除了海量的数据资源,SVAtlas更是一个功能强大的动态分析平台。它为科研工作者提供了一整套内置的计算生物学工具,支持数据浏览、下载、聚类分析和交互式可视化,以辅助识别疾病特异性标志物。平台还创新性地集成了基于大语言模型(LLM)的人工智能问答工具,帮助用户高效驾驭复杂的单EV表征方法。该平台在2024年的亚太细胞外囊泡学会(APSEV)和中国细胞外囊泡学会(CSEV)会议上首次亮相时,获得了国内外科研界的高度评价。
本研究得到了国家自然科学面上基金项目(82473733)和山东省自然科学重大基础项目(ZR2024ZD18)等项目的资助。