[本站讯]近日,山东大学数学与交叉科学研究中心杨建益教授团队在GPCR Dock 2021(G蛋白偶联受体对接国际竞赛)的T01中获第一名。
2021年11月,组委会发起了第四届GPCR Dock竞赛,要求参赛团队一个月内提交预测模型,组委会再基于实验解析的结构对这些模型进行系统评估和比较分析。本届比赛共有来自美国华盛顿大学、韩国科学技术研究院、韩国首尔国立大学、丹麦哥本哈根大学、清华大学和山东大学等单位的45个团队参赛,设有5个GPCRs(T01-T05)。与蛋白质结构预测竞赛(CASP)类似,这些蛋白质的实验结构在比赛时尚未公布,因此属于盲测实验(blind test)。杨建益教授团队开发的trRosettaX和COACH-D等方法,为T01预测的模型在202个模型中排名第一。大赛邀请每个GPCR预测模型的前5名作报告,本届共有14个团队受邀作报告。杨建益教授在报告中介绍了团队在参赛中所做的工作,并指出GPCR结构预测的精度虽然已经很高,然而对接问题仍具有很大挑战性,山东大学团队将在这方面继续努力,通过数学、人工智能和生命科学等多学科知识的交叉,为药物研发等领域提供可靠算法。
GPCR(G蛋白偶联受体)是一类包含7个跨膜alpha螺旋的蛋白质,市场上流通的药物中约三分之一以GPCR为目标靶点,鉴于GPCR的重要性,国际著名结构生物学家Raymond C. Stevens等在国际上发起GPCR Dock竞赛,截至目前,大赛已于2008年、2010年、2012年、2021年分别举办。