1949年初，我山东人民解放军向聚集在青岛、即墨一带的国民党反动派发起了围攻战。在我大军压境的情况下，青岛一小撮国民党顽固派妄图按照蒋介石“保存有生力量，力避就歼”的反动指示逃亡台湾，并在逃跑前企图对青岛市的工厂企业及市政府设施、学校机关等进行破坏和抢劫。这时，山东大学以刘次箫为首的特务分子密切配合青岛反动当局，一方面盗卖学校财产，集结存款准备南逃，一方面策划着把整个学校南迁到台湾的阴谋。敌人很清楚，如果立即提出把整个学校南迁一定会遭到全体师生的反对。为了掩人耳目，敌人采取了各个击破的方法。他们先选中了学生籍贯大部分在南方的水产系，并指示反动学生在校内大造学校南迁到上海复旦大学的舆论，以煽动、欺骗部分对共产党不了解的学生跟着他们跑。

     我地下党组织及时戮穿了敌人的阴谋，使广大同学认识到，敌人放风学校南迁上海，不过是缓兵之计，南迁台湾才是敌人的目的。如果水产系南迁，紧接着就是整个学校的南迁，这就意味着整个山东大学的毁灭。针对这一情况，地下党组织发出了“护校就是当前中心任务”的正确指示。学生自治会按照地下党的指示立即成立了全校性的“应变委员会”及十人护校领导小组，着手发动广大学生阻止学校南迁，并积极采取各种措施保护学校水电安全。当时提出的口号是：“留先生，留同学，留图书，留仪器！”“头可断，血可流，水产系不能走！”于是在地下党组织的正确引导和学生自治会的带动下，全校很快掀起了“反南迁”斗争的高潮。学生们举行了罢课，在校内集会并游行示威，一致表示挽留水产系，纷纷揭露敌人南迁学校的阴谋。水产系有少数师生被敌人的花招所蒙蔽，幻想着去上海复旦大学学习和工作。双方展开了激烈的的辩论，斗争持续了几个月。最后，水产系大部分师生坚决留校，系里的图书、仪器等也大部分保存下来，少数被国民党反动派蒙蔽的同学们和教师乘船赴沪，但很快被复旦大学的革命师生挡了回来。青岛解放后，除少数自散外，南迁的师生大部分返回了学校。

     在反南迁斗争的同时，山大各进步社团还响应地下党的号召，积极开展了护校活动。同学们一方面通过张贴革命标语及广泛散发传递革命信息的《山大生活》校刊，积极宣传护校活动的意义；一方面自动组织护校小组，日夜轮流守护学校的水电设施和仪器财产，在山东大学形成了一个严密的监督网，使敌人无法进行破坏活动。这些护校活动与反南迁斗争相互配合，彻底粉碎了国民党反动派企图破坏学校及把学校南迁到台湾的阴谋，有力地保护了学校的完整和安全，为山东大学以后的发展作了切实的保证。